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PCR实验室气溶胶污染的清洁

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对于任何一个在PCR实验室有工作经验的实验人员来说,PCR产物气溶胶污染,大概是最让人头疼的问题。

多年前,笔者刚刚毕业,进入国内某大型生物技术公司担任研发相关工作,入职第一天,新员工培训的时候,就被反复强调:绝对绝对绝对不可以在电泳间通风橱以外的任何地方,打开PCR产物管盖,一旦发现有这种情况,处理方式就是直接开除。

彼时,笔者经历有限,并不知道PCR产物气溶胶污染的可怕,对此规定仅仅是被动遵守,并无直观概念。此刻,在生物行业蹉跎快20年后,笔者经历了多次PCR产物气溶胶污染,早已是惊弓之鸟。无他,只因一旦发生气溶胶污染,往往即耽误时间拖延工作进度,后续的处理又极其麻烦,就像扑灭火灾,好不容易把明火扑灭,一阵风吹来,往往又是死灰复燃,让人心力交瘁。

对于一个PCR实验室来说,很多布局和规定,就是针对产物气溶胶污染的,如四个分区,如正负压系统,如人员物品流动的单向性规定,如定期清洁,以及目前广泛采用的UNG酶防污染PCR体系等等。然而这些措施并不能完全预防,产物气溶胶污染宛如一个幽灵,时不时在实验室肆虐一番。

一旦发生PCR产物气溶胶污染,需要立刻进行清洁处理,但很多时候,清洁处理不得法,往往不能彻除污染。




清洁处理的手段
1. 紫外照射
实验室日常清洁过程中,均有紫外灯照射这一流程,紫外线照射清除DNA污染的原理:DNA链上相邻的嘧啶在254nm的紫外照射下产生交联,形成嘧啶二聚体,该二聚体可导致合成反应时模板不能完全变性,同时聚合酶作用空间被阻碍,从而使合成反应终止。

但是紫外线在去除PCR产物气溶胶污染中存在两个问题,首先,造成污染的扩增产物长度往往比较短,空间上,相邻嘧啶出现的概率偏低,该方法作用有限,其次实验室紫外灯照射强度与紫外灯功率,照射距离还有遮挡等因素相关,很多时候照射强度不够或存在照射不到的死角,均会影响清洁效果。

因此紫外照射对PCR产物气溶胶的污染清除,只有辅助作用。

02. 乙醇
在日常实验室清洁中,75%的乙醇是常用试剂,理论上来说,乙醇并不能清除DNA的污染,在实验室清洁中乙醇往往是作为消毒剂使用。实际上在日常实验室清洁和去除气溶胶污染时,先用75%的乙醇对实验室空气进行密集喷淋,可对空气中的气溶胶产生较好的沉降效果,喷淋后立刻用其他DNA清除试剂对实验台面,实验器具,地面等进行清洁,往往能取得较好的污染去除效果。

03. 盐酸
器具用1mol/L盐酸擦拭或浸泡,可使DNA脱嘌呤,但是分子实验室中可采用该方法的器具并不多,主要是玻璃器皿,同时对使用人有一定的危险性,因此采用的并不多。


04. 次氯酸钠和过氧化氢
次氯酸钠和过氧化氢均具有强氧化作用,可氧化破坏DNA分子的结构,也是实验室中常用的气溶胶污染去除试剂,通常使用一定浓度的84消毒液或双氧水对实验室地面,台面及其他耐腐蚀器具等进行清洁,但也因其强氧化作用部分实验仪器器具,比如移液枪,不锈钢器具,离心机等不可采用这些方式进行清洁。


05. 其他核酸去除试剂
随着PCR实验越来越多的使用,市场上也出现了很多针对PCR产物污染的清洁产品,这些产品去除污染的原理有多种,如采用修饰法阻止合成酶的结合,或采用酶消化法降解,以及采用螯合法,进一步的有螯合后再降解去除等方式,对于这些试剂的使用,要先确认其使用场景,设计实验进行测试,以确认其效果,优缺点,采用适宜本实验室的试剂。

参考资料:https://mp.weixin.qq.com/s/tT7ztigP9Rs6sZfLS9U-rw



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