mRNA ployA尾序列如何鉴定？

大家都知道ployA序列的长度和准确度对mRNA的稳定性非常重要，有什么办法能够很好的测序质控嘛？

目前主要通过质谱或测序的方法来对polyA尾来进行质控。质谱的方法是先通过酶将polyA切下来后打质谱，分析polyA的出现的长度就行。测序方法可以分为两种，一种是利用Sanger测序，这个测序需要优化测序试剂及反应条件，目前只有少数公司能做，好像Thermo也推出了试剂盒。另外一种是利用PacBio测序来做，不需要将polyA单独切下来做，可以直接得到全长序列，由于建库过程中涉及到逆转录及PCR过程，会带来一些假阳性序列结果，整体测序表现与质谱相当甚至更好点，有不少文章已经介绍了相关的方法，可以自行查看下。