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利用ONT测质粒全长时,如何解读测序出reads长度分布图?

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相较Sanger测序,测序出来的质粒全长序列能够反映样本中质粒真实的长度信息,检测到各种结构变异和突变。

ONT对质粒进行建库时,是采用Tn5酶打断并加上接头,通过调整Tn5酶量和接头oligo的量,就能实现绝大多数质粒只是被线性化,而不会被随机打断成多个片段。这个是这个实验的关键。



Fig 1. 长度柱形图中表明了样本中只有一个主克隆质粒



Fig 2. 长度柱形图中表明了样本中除了一个主克隆质粒外,还有其它重组DNA片段。

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